“来，芭瓢虫，这是你的午餐。”小智精心为芭瓢虫准备了特别的午餐和适当的训练来慢慢调节它的身体，让它恢复最佳状态。
小智用波导检查芭瓢虫的时候，发现它体内有一股强大的力量，不过这力量十分狂暴，芭瓢虫根本无法驯服，这或许就是它悲剧的源头吧小智也不急的让芭瓢虫得到这股力量，这股力量需要慢慢引导出来才是最佳选择。
芭瓢虫很高兴的吃着自己的午餐，不过突然它觉得自己背上阴风阵阵，让自己觉得好像被什么盯上了一样，回头一看，发现小智的其它神奇宝贝正在用羡慕小锯鳄，火球鼠嫉妒菊叶草，美纳斯，猫头夜鹰恨的看着它，它们的头变得越来越大，让芭瓢虫不由自主的狂冒汗。
“好了，好了，各位，你们的午餐在这里。”这时候小智出来解围了，端着五份神奇宝贝食物，所以的神奇宝贝都高兴的扑到小智身上。
“等等，我手里还拿着东西，别全部扑过来，皮卡丘，小刚。”小智很快被自己的神奇宝贝压倒了，不断亲昵小智，小刚和皮卡丘几时的跑过来帮小智那住神奇宝贝食物。
“好了，好了，真拿你们没办法。”小智就躺在地上伸手摸了摸它们，不过这时候皮卡丘和伊布也来捣乱了，都扑倒了小智脸上。“我说，皮卡丘，伊布，你们怎么也来凑热闹，快下来吧，我都看不到了。”
“皮卡”“布伊”不要
“小智还真是受神奇宝贝欢迎。”小霞感叹到。
“嗯，这或许就是小智的魅力。”小刚也点了点头，而安瓢虫则一脸羡慕的看着小智。
“那边那位少年，你是神奇宝贝训练家吧”而这时候出现了一位穿着红色衣服的女生，她的伙伴则是一只长尾怪手，女生看到了被神奇宝贝压着的小智。
“是的，我是小智，是一位神奇宝贝训练家。”看到有人来了，美纳斯它们都很自觉的离开小智身上，让小智站起来，而皮卡丘和伊布就停在小智肩膀上。
“我叫做小刚，美丽的小姐，请问你的名字是”小刚看到美丽的大姐姐，瞬间冲了过去，简直和瞬间移动一样，一眨眼就就现在女生的面前。
“我叫做小凌，怎么样，能请你和我做一场对决吗”女生做了自我介绍后，并向小智提出了请求。
“当然”，小智从来都不逃避对战，欣然同意了。
“小锯鳄，决定是你了”，“布鲁皇，上吧”。
结果很明显，小智的四只神奇宝贝打败了小凌的六只神奇宝贝美纳斯和芭瓢虫没有参战。
“没想到你这么强，我们完全是败了，还要继续加油。”比赛结束了，大家就一起坐下吃午餐。
“还好了，都是大家努力的结果。”小智也看着自己的神奇宝贝正在吃着饭，脸上不自觉的露出了高兴的笑容。
“对了，小凌，你知道这附近哪里有神奇宝贝中心吗”小刚则是随后问道，要恢复体力还是去神奇宝贝中心比较好，而且还可以给神奇宝贝们做一下全身的检查，防止有隐患，当然还有去看看那里的乔伊小姐。
“靠近这里最近的就是穿过这片森林后方的绿色草原镇，那里有神奇宝贝中心”。
“绿色草原镇，听起来就好漂亮，让人有一种休闲舒适的感觉，那里可是城都地区，女生最想去的地方之一啊”小霞听了小凌的话感慨的说，而小智一听“绿色草原”这几个字，心头瞬间就有“结晶塔的帝王”，“未知图腾”，“炎帝”这几个信息浮现在脑海里，没想到他们已经走到这里了。
“是的，我也正要去那里呢”，原来小凌也要到那里去，于是四人吃过午饭，就结伴向绿色草原镇走去。
“绿色草原是一个绿意盎然的和平之地，那里吹拂的微风，可以安抚人和神奇宝贝的心灵，我很早之前就想要去看一看呢。”走在路上，小霞对于绿色草原非常的期待，不过话说小霞，你想去的不是大海吗
“女生最想去的地方，那里肯定会有许多的美眉，嘿嘿嘿”小刚看起来很猥琐，他对那里的大姐姐们很是期待。
“这里真的很美啊”，走出了森林，就看到遍地的不同颜色的花朵，一直想着接下来的事情的小智都不由放松了心情，一阵微风拂过，带来阵阵花香，让人沉醉其中。
“越过那个土丘，就可以看到绿色草原了。”又走了一小段路，小凌指着前方微微凸起的小土丘对小智他们说道。
“是吗那就快点去看看吧”，四人激动的向着前方冲去。
“这是什么”本来满怀希望，可以看到美丽的草原，可是映入他们眼帘的却是另一番景象，一座高高的直耸云霄的结晶塔，结晶呈辐射状向四周延伸，没有了艳丽的花朵，没有了碧绿的小草，更没有了悠闲生活的神奇宝贝们，只剩一大片蔓延的结晶，而且还在缓慢的向外延伸着，就在他们的眼前，绿地就这么消失了，变成了结晶地，小霞看到后非常的不相信，这到底是怎么回事。
“君莎小姐。”而这时，小刚看到君莎小姐从他们后面的一条大路上疾驰而过，并没有停留，而后又有一辆车过来了，是电视台的，他们通过电视报道向全世界展现了这里的问题。
“我们先去神奇宝贝中心。”在这里也得不到什么有用的信息，所以小智建议说，随后三人就来到了神奇宝贝中心，这里还没有被结晶波及。
“好多的专家学者都抵达了这里。”到了神奇宝贝中心为神奇宝贝恢复体力后，电视台的报道也来到了这里，随着主持人的话就看到来了一辆汽车。
“大木博士。”走下车的是大木博士，小智当然要上去打招呼了，随后小智又看到自己的妈妈从车上走了下来，在这里可以看到妈妈，小智非常的高兴。“妈妈。”
“啊，小智，你们也在这里啊。”花子也很高兴可以碰到小智，直接跑过去抱住小智，“你这孩子，又瘦了，看来又不爱惜自己了。”
“对不起，妈妈。”小智也紧紧抱住妈妈，原本自己想说的话被花子这样一抱，全部都抛到脑后了。
通过和妈妈的聊天，大家也知道了那座房子是秀力博士的家，秀力博士以前是大木博士的学生，到过真新镇好几次，而且还指导过小智的妈妈学习，所以他们关系很好，小智的妈妈还随后拿出了一张照片，上面是大木博士、小智及小智妈妈和秀力博士一家三人，因为已经从秀力博士的助手那里知道了秀力博士失踪了，所以小智的妈妈对秀力博士的女儿小米非常的担心。
聊着聊着，小智突然脸色一变，严肃的看着结晶塔的方向，他发现一个模糊的波导高速的朝这边移动。
“皮卡丘”小智，有情况。就在这时皮卡丘也朝着结晶塔的方向叫了起来。
“怎么了吗”小霞好奇的问。
“有东西过来了。”小智看到远处一个不断跳跃前进的身影，开始严肃了起来。
“这个是什么神奇宝贝，还是第一次见到。”一眨眼的功夫，那只神奇宝贝就来到了眼前，而且它的脚下开始结晶。
“是炎帝。”小智为大家解释说，“妈妈，退后。”小智看到妈妈走上前去，立刻焦急的把妈妈拉了回来，因为小智知道炎帝是想把自己的妈妈抓走来给秀力博士的女儿小米做妈妈，小智当然不会让自己的妈妈身陷危险。
“不要多管闲事，我要带走妈妈。”炎帝则是通过心电感应向大家表达自己的意思。
“那是不可能的，谁都别想在我面前把我的妈妈带走，虽然你不是真的炎帝，不过就算是真的来了也不能带走我妈妈。”小智直接拒绝对方。
“那就不要怪我了。”随后从炎帝嘴中吐出一道紫红色的火焰，向着这边打来。
“皮卡丘，十万伏特。”小智也立刻让皮卡丘使用了十万伏特黄色的电流和橙色的电流彼此交缠，逐渐壮大，和炎帝的喷射火焰碰到了一起，随着“砰”的一声，产生了爆炸，激起了大量的烟尘。
“啊”，大家都被这股力量给吹了出去。
突然炎帝从烟雾里跳了出来，对着小智使出大字火。
“皮卡丘，电球。”皮卡丘丢出电球，和大字火互相抵消，再次激起大量烟雾。
“皮卡丘，九点钟方向，高压电击。”小智的波导感应到九点钟方向有一个物体正高速朝花子跑过去，皮卡丘全身带着电流变那个方向跑去，成功截住了炎帝。
不过炎帝被皮卡丘撞到后摔在地上翻两个滚，“砰”的一声消失了。
“不好，是替身。”小智没想到炎帝居然这么狡猾，他突然发现三点钟方向一个波导已经突破他的防御范围，跑到了花子那里。
炎帝瞪了一下花子，花子马上被催眠了，倒在了它的背上，这时炎帝准备撤退，它不想和小智过多纠缠。
“放开我的妈妈，皮卡丘，电光石火。”花子已经在炎帝背上了，皮卡丘不能使用电击，这样冲向去，不过它也是非常心急，一下子居然跳到炎帝面前。
炎帝对皮卡丘可不会手下留情，在皮卡丘还在半空中的时候，嘴里燃烧着紫红色的火焰，它使出“喷火”，巨大的火柱直接击中皮卡丘，将皮卡丘全身都烧伤，炎帝转身就跑。
“皮卡丘。”小智这时候面对两难的境地，一边去妈妈，一边去皮卡丘，最后他还是选择去看看皮卡丘的情况，妈妈在炎帝手中并不会受到伤害，但皮卡丘已经严重烧伤了，急需治疗。
“皮卡丘，我马上带你去神奇宝贝中心。”小智抱起受伤的皮卡丘朝神奇宝贝中心跑去。
“小智，皮卡丘，没事吧。”小刚他们终于赶到了在神奇宝贝中心，看到小智失落的坐在旁边，而伊布舔了舔小智的脸，表示安慰。
“没什么问题，只需要休息一下就可以了。”小智抱起伊布，轻轻的摸着它的绒毛。
“炎帝为什么要抓走伯母”小霞问道。
“我们去找大木博士问一下吧”小刚则是建议大家说，随后大家就来到了大木博士所在的房间，看到大木博士和秀力博士的助手正在研究着什么。