任凭风浪起，吴佩孚在衡阳则照样我行我素，完全不理会各方的反对和谴责。
别人有问，他必有答，别人有来言，他有去语。这是个极善针锋相对的人，因为段祺瑞电报中责吴说“尔从予多年，教育或有未周”句。他便在复电中戏称段为“我师”，自比“诤子”，他说自己通电主和乃是“仿照我师在孝感时通电主张宣布共和，实系由我师教育而来。”
段的电中说“军人应尽服从之天职。”吴的复电则说“学生直接服从者曹使，间接服从者陆海军大元帅（指冯代理总统）。大元帅希望和平，通国皆知。经略使在汉表示和平，学生即根据实行，谨守服从，无以过之。”
以其人之道还其人之身，吴秀才的巧言善辩，让段祺瑞哭笑不得，也让世人引为笑谈。
他在通电中最引人注目的，是对张作霖回击“津议阳为去冯举徐，阴实倒阁复辟，干犯纪纲，莫此为甚。蛮军（指奉军）满布畿辅，雷震春、张镇芳、万绳栻、胡嗣瑷等遁迹津门，与某督秘密连系，是为明证。”
接着，吴又有电致段，否认主和是受人之欺“倡议和平，实出学生本心，即非受人嗾使，亦非被人愚弄。……大势所趋，非和无以善其后，如果中央能欣念民主……毅然为和平之表示，西南必当就我范围，实在学生把握之中。……如蒙俯如所请，则南人不反，担保十年。后如无效，学生以一师之力，平之足矣。”
在保定的曹锟很无奈，对于自己的这个得力干将，只能是善言训斥“宥电悉，引经据典，大放厥词，施之于同等尚且不可，顾可于尊长之前妄发议论？宁不知芝揆（指段祺瑞）再造共和，淡于权利，只以大局所关，同人邀请，不得已再出东山，其所以不能遽事和平者，实因南人复反也。……来电谓宣战媾和为大总统特权，不知媾和者，乃对外，国内疆吏跋扈，武人肆虐，惟有出于讨伐之一途。又津议种种尤为无稽之谈。该师长信以为真，何愚暗至此。……芝揆素有含容，兼与该师长有师生之谊，应即具电婉言谢过。幸勿再逞意气，致贻他人以口实。是为至要也。”
吴佩孚对北方局势看得很真切，他了解段祺瑞今日在北洋派中，只是一个虚声号召的领袖，并没有强大而坚固的实力作后盾。至于那些气壮如牛的督帅们，又都是些自私自利之辈。吵吵闹闹是可以的，一旦真刀真枪就胆小如鼠了。
事实上，无论是段祺瑞还是曹锟，不管对吴秀才如何不满，但也只是口头上指责，而不敢有进一步的行动，诸如撤职查办之类。
吴虽只是个师长，但手握一支能征善战的劲旅，又驻在最前线。如果把他逼急了，率部投向南军，后果肯定不可设想。
这位吴秀才果然有持无恐，竟敢发电叫号“如不允下停战令，师长等回防待罪，请即派员接替。”
曹锟不是不爱护吴，只因身在北方，身不由己。又何尝不知吴是他的政治资本，但投鼠忌器，只好作面文章，用电斥吴来敷衍各方。
三十一日吴佩孚有答复曹锟电，表示坚决主和“一俟和局告成，当北上请抗言之罪。”
北方军人中也有多人附和吴佩孚主和，如原驻防江苏，刚调到江西的第十九师师长杨春普，就几次发出通电响应吴。
吴佩孚也借此大做文章，把所有同情和响应他的通电都转交全国各报发表。
自己营垒内的反戈一击，有更大的杀伤力。主和声浪和谴责中日密约、痛斥安福国会呼声汇集到一起，波涛汹涌。强大的舆论压力下，段祺瑞被逼无奈只能把武力统一政策推迟一步了。八月三十一日国务会议决定，命令前敌各军暂取守势。
这样一来，吴秀才这个小小的师长，就一跃而成为扭转乾坤之人。
不仅如此，同日，段发出通电，宣布本人将在政府改组后引退。
电云“往者滇黔诸省独立自主，祺瑞仰承明令，从事讨伐，方据全胜之势，忽倡调停之说，祺瑞引咎乞休。讵中央方从事调停，而长岳失势，荆襄扰攘。彼时祺瑞专事筹边，不愿再综政权，而大总统亲自敦促，我同袍函电交驰，迫不容己，重负仔肩。受任以来，仍以统一为职志，和平为希望，与大总统同心同德，备挽劫运。荏苒经时，而统一之局尚需时日，将士疲劳于外，人民疾苦于下。
“今值国会告成，组织大总统选举联合会，元首改任之时，即政局重新之会，祺瑞自应及时引退，遂我初服。……所有前敌各军队，希即明修战备，严防煽惑。倘有疏虞，危及国本，则前敌诸将领与任地方之责者。对于国家人民，皆有不可辞之咎也。”
段这通电报是在安福系操纵的国会已经开会，改选总统，合法倒冯的时机已经成熟时发出的。他先表示下野，是以此迫冯国璋实践同时引退的诺言。
但他下台后，不但是新选的总统的后台老板，还保留了参战督办职务。说是下台其实还是在台上，而冯下台可就是真的下台了。
冯段两人的斗争，在安福国会召开后，冯已是彻底失败了。
段系决定不顾一切改选总统，南方的桂系则尽一切努力想延长冯国璋的总统任期。
八月三十一日广州非常国会宣言，将继续召集护法会议，并进行总统的选举。对于所有北京政府缔结的对外条约和公布的法律，一概认为无效。政学系的议员进一步主张即选冯国璋为大总统。
九月二日广州的军政府发表宣言，否认安福国会有选举总统之权，如果选出了总统，西南决不承认。
段祺瑞仍然一意孤行，为怕选举发生意外，召奉军一旅开到南苑。
张作霖借机向北京政府呈请恢复张勋的自由，而康有为又公然到了北京，于是北京内外人心皇皇，以为又要发生第二次复辟。
九月四日，安福国会组织两院选举，到会议员四百三十六人，徐世昌以四百二十五票高票当选为总统。
据说投票前每位议员都领了出席费和一张徐世昌亲笔题名的照片，少数不受控制的议员则以每张票五千元收买，由安福系所办的华通银行付款。
整个大选经费是从日本借款中提出的。议员们在投票后，段内阁分别不同身价聘他们为顾问、咨议，每月送干薪二百元到一千元不等。
九月五日继续选副总统，两院议员到者仅八十八人，因人数不足流会。副总统本有四个人有希望竞选，是冯国璋、段祺瑞、张作霖、曹锟。冯、段已有承诺同时下野，张作霖亦自动放弃，于是只剩下曹锟一人。
交通系主张不要选北洋军人，“以免西南更走极端，俾让徐世昌发动和平”。代言人是旧交通系领袖梁士诒。
北洋部分军人认为梁是广东人，说他是想促成南方人当副总统，梁士诒则说他是希望缓选副座以留待对统一和平有功之人。
梁曾有函致北洋军人申述自己意见书云“夫主张速选者，本谓选出曹使，则北洋系固结可期。士诒忝厕北洋有年，北洋系之固结，迩年来竭力经营，未尝稍懈。然士诒爱北洋系，而尤爱国家；且爱国家，即所以爱北洋系也。夫主张速选，以固结北洋系者，惟知固结北洋系，而不知因此足令国家分裂。曷言乎足令国家分裂？今日大总统已下令劝和，全国士商，多求罢战，是和平统一已为全国心理所同趋，苟无意外之阻力发生，则和平统一，当可告成。今若速选曹使为副座，则全国士商，不免大起猜疑，将谓中央又复主战，而西南人士，必以为故表对敌之意，是使已熟之和平终于无果。
“此足令国家分裂理由一也。西南对于主座之个人，本是同钦共仰，惟对于主座之选举，犹以违法相攻，今若选曹使为副座则彼等必合个人与选举而并攻之，其终也必至危及主座，若是则政局愈纷，去和平统一愈远矣。此足令国家分裂之理由二也。副座未选之前，则西南犹怀或归己得之望，此望未绝，则和平统一之机尚存。若一旦选出，则此望遂绝，而彼等必自行选举，若是则南北分立之局以成，而和平统一终于无望。此足令国家分裂之理由三也。有此三理由，故士诒主张缓举为有益于时局也。”
梁士诒因此一主张而和直系结怨，日后梁组阁受到的激烈反对，很大部分由此而起。
徐世昌当选总统后有电谦辞，这是北洋政府官僚们例行地故作姿态。
电云“国会成立，适值选举总统之期，乃以世昌克膺斯选，世昌爱民爱国，岂后于人，初非沽高蹈之名，并不存畏难之见。惟惓念国家杌陧之形，默察商民颠连之状，质诸当世，返诸藐躬，实有非衰老之躯，所能称职者。并非谦让。实本真诚，谨为我国会暨全国之军民长官并林下诸先生一言，幸垂听焉！民国递嬗，变乱屡经，想望承平，徒存虚愿，但艰危状况，有什佰于当时者。道德不立，威信不行。纪纲不肃，人心不定、国防日亟，边陲之扰乱堪虞、欧战将终，世局之变迁宜审。
“其他凡事实所发现，情势所抵牾，当局诸公，目击身膺，宁俟昌之喋喋？是即才能学识，十倍于昌，处此时艰，殆将束手，此爱国而无补于国，不能不审顾踌躇者也。国之本在民，乃者烽火之警，水潦之灾，商业之停滞，金融之顿挫，土匪劫掠，村落为墟，哀哀穷民，无可告诉。吏无抚治之方，人鲜来苏之望，固无暇为教养之计划，并不能苏喘息于须臾。忝居民上，其谓之何？睹此流离困苦之国民，无术以善其后，复何忍侈谈政策，愚我编氓？此爱民而无以保民，更悚惕而不自安者也。
“然使假昌以壮盛之年，亦未尝无澄清之志。今则衰病侵寻，习于闲散，偶及国事，辄废眠食。若以暮齿，更忝高位，将徒抱爱国爱民之愿，必至心有余而力不足，精神不注，丛脞堪虞，智虑不充，疏漏立见。既恐以救国者转贻国羞，更恐以救民者适为民病，彼时无以对我全国之民，更何以对诸君子乎？吾斯未信，不敢率尔以从，心所谓危，谨用掬诚以告，惟我国会暨我全国之军民长官，盱衡时局，日切隐忧，所望各勉责任，共济艰难，起垂蹙之民生，登诸衽席。挽濒危之国运，系于苞桑。昌虽在野，祷祀求之矣。邦基之重，非所敢承，干济艰屯，必有贤俊，幸全尘翮，俾遂初服。除致函参众两院恳辞，并函达冯大总统国务院外，特此电达。” 。